形态特征和物理性质的鉴别
根据矿物类中药材的晶型（系）及性状、颜色、粉色、透明度、光泽、解理、断口、硬度、相对密度、磁性和电性等物理性质的不同，鉴别矿物种属的方法。
如具白色纤维状的石膏；淡蓝绿色纤维状的阳起石；相对密度较大的朱红色的朱砂，红黄色的雄黄；晶莹透明的白石英；半透明状的紫石英；赭红色并具钉头的代赭石；具油脂光泽的淡黄色琥珀；块块方解的方解石；参差状断口的自然铜；平坦状断口的赤石脂；标准硬度为一级的滑石，为1.5级的信石，为2级的石膏；相对密度为2.7-2.8的是滑石，7.4-7.6的是密陀僧；具磁性的磁石；具导电性的金、银、铁和具绝缘的云母石等。
需要注意的是，以矿物的形态特征、物理性质鉴别矿物中药材，多数情况下需把各方面性质结合起来分析，才能收到好的效果，如对自然铜、花蕊石不同品种的鉴别，以及对石膏、硬石膏与方解石的鉴别等。
化学分析鉴别
根据矿物中药材中所含化学成分以鉴别原矿物的方法。如在一定浓度的矿物原液中滴加盐酸后，有强烈起跑现象的是碳酸盐类矿物（钟乳石、花蕊石、石燕、石蟹）；于一定浓度的矿物溶液中硫氢酸铵试液2滴，显雪红色，再加亚铁氰化钾试液1-2滴，即发生蓝色沉淀，再加25%氢氧化钠溶液5-6滴，沉淀变成棕色，是氧化物类矿物赤铁矿等。
显微观察鉴别
将矿物制成标本片，置显微镜下观察其形态特征，以鉴别不同矿物的方法。
生物显微镜鉴别
将矿物标本片置于一般的生物显微镜下观察形态特征，以鉴别矿物中药材的方法，如对朱砂、石膏、紫石英等的鉴别。
偏光显微镜鉴别
将磨制好的矿物标本片置偏光镜下观察矿物的晶形及其晶体光学性质（折射率、解理、颜色、突起、消光现象，干涉色、延性、双晶等）以鉴别矿物的方法。适用于透明矿物及部分半透明矿物质的鉴别，如对石膏及其易混药材硬石膏、方解石的鉴别；对寒水石与方解石的鉴别等。
反光显微镜鉴别
将磨制好的矿物标本片置于反光显微镜下，根据其晶形、反射色、反射率、内反射、双反射、硬度、偏光性和偏光图等以鉴别不同矿物的方法，适用于半透明或不透明矿物的鉴别。
仪器分析鉴别
采用先进科学的一起设备对矿物中药材进行全面分析和研究的可靠、快速鉴别法。常用的有发射光谱分析法、X射线衍射分析法，激光显微光谱法，极谱分析法、电子显微镜法等。如用反射光谱分析法对石膏及其易混药材硬石膏、方解石的鉴别研究等。
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